[例行抢跑] 巴塞尔报告（第五期，2022年9月19日）

原创拍老师拍帮主 2022-10-06

前言

各位早上好中午好下午好晚上好~
《巴塞尔报告》系列的第五期，其实上周五就放出来了，但周末有其他的东西要写，所以一直没来得及搬~趁着这货还在保质期，今天赶紧搬运了吧。（上期回顾：《巴塞尔报告（第四期，2022年9月2日）》）

在正式搬运瑞士内参之前，先简单瞅一眼近期变异株增长速度排行榜。
——请品鉴啦（可能需要点开大图）：

简单解释一嘴：

以上排行榜按相对增长速度的置信区间最小值排名；
前两名已经被BQ.1.1和BA.2.3.20占领；
之前提到过，由于不能确认输出病例占比，所以BQ.1.1的相对增长优势有可能虚高，还需要再观察——现在这一条已经不适用了，BQ.1.1已经开始在英国等地出现数目不少的社区病例；
由于拥有先手优势，以及获得额外增益突变的效率更高，所以BA.2.75家族最终成为全球主流毒株的预期暂时不变。

下面开始正式搬运。

第一部分，下一波由新发变异株主导的疫情最迟将在3个月内爆发

BA.2.75.2目前仍然以每周翻倍的速度稳定增长；
在9月初，BA.2.75.2在欧洲的市占率约为0.1%-0.5%，在亚洲、大洋洲和北美洲的流行率则有0.5%-5%之间；
如果保持上述增速，BA.2.75.2将在两个月以内成为全球主流毒株，并因此带来发病率增长——下一波由新发变异株主导的疫情将在11月爆发——并且这一估算还没有考虑气温和季节的影响因素（拍老师的画外音：上一期的时候Cornelius小哥预测的10月底爆发）；
作为旁证，目前BA.2.75.2取代BA.5的速度，跟之前BA.5取代BA.2的速度基本持平，既然之前BA.5有可能主导一波爆发，则合理推测BA.2.75.2也没问题；
在测序记录数量大于350条的分支里面，BA.2.75.2仍然是增长速度最快的一个分支（如果不考虑绝对数量的话则是BQ.1.1最快）

第二部分，BQ.1系列有可能取代BA.2.75.2

之前一段时间，普遍认为对于BA.5的backbone来说，增益效果最大的点突变是刺突蛋白R346T，但BQ.1系列的现身说明了，可能还有增益更大的点突变（拍老师的画外音：也有可能是人群免疫背景变了…）
BQ.1即BA.5.3.1.1.1.1.1，它在原始版BA.5的基础上额外获得了刺突蛋白K444T和N460K突变（BA.2.75同款）；
BQ.1的父毒株（BE.1.1.1）最早在7月份现身尼日利亚，BQ.1本身也最早在尼日利亚冒头，所以合理估计BQ.1的起源地在西非（也有可能是尼日利亚周边其他国家/地区）；
BQ.1在冒头之后，迅速获得了额外的刺突蛋白R346T突变（即BQ.1.1）；
BQ.1系列有可能会和BA.2.75系列一起导致秋冬季的双毒株共同爆发，也有可能在BA.2.75爆发结束之后马上主导下下一波（拍老师的画外音：也就是说下下一轮的代表已经准备就绪…）

第三部分，一大波新发变异株不约而同地获得了刺突蛋白N460K突变

之前提到过N次，Omicron大家族一直在搞轰轰烈烈的趋同演化（拍老师的画外音：顺便卖个关子，过几天搬运一篇这方面的paper，含焦量巨高）
上一期，也就是两周以前，趋同演化的重灾区还是刺突蛋白346、444、450等位点，两周之后，潮流就完全变了，开始流行刺突蛋白460位点了；
相对增长优势排行榜的前十名，几乎全都带了刺突蛋白N460K突变，包括：BQ.1系列、BA.2.75系列、单枪匹马杀到第二名的BA.2.3.20等；
另外一个值得注意的子毒株是BS.1（即BA.2.3.2.1），最近由日本入境检疫在越南输出病例身上陆续检出，推测这货在越南的流行率不低。BS.1的刺突蛋白突变列表如下：

Y144-, G257V, R346T, L452R, G476S, N460K, Q493R, S640F

总结总结：

以上！

以上！本人知识星球暂时下线~
预计9月24日恢复。
如需留言评论，请移步后花园：